Para o exercício das suas competências, o DCeT conta com os seguintes três órgãos de gestão: Diretor, Conselho Coordenador e Plenário.
O DCeT encontra-se organizado em três secções ( "Ciências Aplicadas, Ambiente e Sociedade ", "Informática, Física e Tecnologia " e "Matemática ") as quais enquadram as atividades de ensino, investigação e extensão universitária dos seus 40 docentes.
Para o apoio às suas atividades letivas (cursos de 1º e 2º ciclo e ações de aprendizagem ao longo da vida), bem como à sua organização e gestão, o DCeT possui um secretariado próprio, atualmente constituído por cinco secretárias.