A Universidade Aberta estrutura -se em:
Unidades orgânicas
· Departamentos;
· Instituto Coordenador da Investigação.
Outras unidades organizacionais
· Unidade para a Aprendizagem ao Longo da Vida (UALV);
· Unidade de Produção e Gestão de Conteúdos de Ensino (UPGCE).
Serviços
· Serviços centrais;
· Serviços desconcentrados.
É obrigação das unidades orgânicas, das unidades organizacionais e dos serviços cooperarem entre si, por forma a servirem, a todo o momento, os objetivos estratégicos da Universidade.